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蒋庆华：哈尔滨医科大学医工交叉学院教授、院长，国家杰出青年科学基金及国家优秀青年科学基金获得者，主要从事生物信息学研究，聚焦肿瘤治疗性mrna疫苗设计、癌症智能早筛、人脑单细胞时空图谱绘制等前沿方向，主持科技创新2030—“新一代人工智能”重大项目1项、国家基金委杰青、优青、重点、面上等项目6项，以第一或通讯作者身份在cell、cell discovery、cancer research、oncogene、pnas、nar、bioinformatics等期刊发表论文80余篇，获中国百篇最具影响国际学术论文2篇，以第一、第二完成人获黑龙江省自然科学一等奖2项。担任中国计算机学会生物信息学专委会常务委员、中国人工智能学会生物信息学与人工生命专委会常务委员、中国自动化学会智能健康与生物信息专业委员会委员、中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会肿瘤测序及大数据分析协作组常务委员，曾担任基金委信息科学部重点、面青地项目会议评审专家，生命科学部重大、重点、区域联合基金重点以及面青地项目会议评审专家。

教育经历

2007.03 - 2010.06  哈尔滨工业大学  计算机应用技术       博士

2003.09-2006.07  吉林大学  计算数学及应用软件   硕士

1999.09 - 2003.07  吉林大学   信息与计算科学  学士

工作经历

2023.02–至今 哈尔滨医科大学 医工交叉学院 院长

2017.05–2021.04  哈尔滨工业大学  生物信息党支部     党支部书记

2017.11–2020.10  哈尔滨工业大学  生命科学与技术学院    院长助理

2015.12–2023.01  哈尔滨工业大学  生命科学与技术学院    教授（破格）

2013.12–2015.12  哈尔滨工业大学  生命科学与技术学院    副教授                        

2011.11–2012.11  哈佛大学        医学院                访问学者

2010.08–2012.12  哈尔滨工业大学  生命科学与技术学院    讲师

科研项目

1) 科技创新2030新一代人工智能重大专项，重大项目，基于外周免疫特征的泛癌种智能早筛关键技术研发（2022zd0117700），2023.3-2026.2，1500万，主持

2) 科技部&雄安新区科技创新专项，基于多组学数据及人工智能的癌症mrna 疫苗设计与构建（2022xaggo117），2022.10-2025.9，2600万，主持

3) 国家自然科学基金委员会，杰出青年基金，复杂疾病的组学大数据处理与挖掘，2024.1-2028.12，400万，主持

4) 国家自然科学基金委员会，重点项目，基于单细胞多组学数据的癌症模式挖掘理论与方法研究（62032007），2021.01-2025.12，299万，主持

5) ***妇幼保健院，横向项目，基于单细胞多组学测序的少儿精神及神经系统性疾病的发病机制研究（ky-2022-001），2022.1 -2026.12，1425万元，主持

代表性论文

1) songren wei#, meng luo#, rui chen#, jiangping xu#, xiyun jin, chang xu, xiaoyu lin, chenyang li, hongxin liu, rui cheng, zhaochun xu, wenyi yang, yideng cai, guangfu xue, jinhao que, wenyang zhou, peng huang, xi su, shuilin jin, pingping wang*, qinghua jiang*. charting the spatial transcriptome of the human cerebral cortex at single-cell resolution. nature neuroscience. 2023. (minor revision). (sci if: 25.00)

2) yideng cai^#, meng luo ^#, wenyi yang, chang xu, pingping wang, guangfu xue, xiyun jin, rui cheng, jinhao que, wenyang zhou, yu li, zhaochun xu^*, qinghua jiang^*. icantcr: a deep learning framework for early cancer detection using t cell receptor repertoire in peripheral blood. cancer research (accepted) (sci if: 11.2)

3) wenyi yang#, meng luo#, yideng cai, chang xu, pingping wang, songren wei, guangfu xue, xiyun jin, rui cheng, jinhao que, wenyang zhou, fenglan pang, qinghua jiang*, huan nie*,  zhaochun xu*. deepcci: a deep learning framework for identifying cell-cell interactions from single-cell rna sequencing data. bioinformatics. 2023 oct 3;39(10):btad596. (sci if: 5.8)

4) chang xu#, xiyun jin#, songren wei#, pingping wang, meng luo, zhaochun xu, wenyi yang, yideng cai, lixing xiao, xiaoyu lin, hongxin liu, rui cheng, fenglan pang, rui chen, xi su, qinghua jiang*. deepst: identification of spatial domains in spatial transcriptomics by deep learning. nucleic acids research. 2022 dec 9;50(22):e131. doi: 10.1093/nar/gkac901 (sci if: 19.16)

5) x ren#, w wen#, x fan#, w hou#, b su#, p cai#, j li#, y liu#, f tang#, f zhang#, y yang#, j he#, w ma#, j he#, p wang#, q cao, f chen, y che, x cheng, g deng, x deng, w ding, y feng, r gan, c guo, w guo, s he, c jiang, j liang, y li, j lin, y lin, h li, j liu, n liu, s liu, m luo, q ma, q song, w sun g wang, f wang, ywang, x wen, q wu, g xu, x xie, x xiong, x xing, h xu, c yin, d yu, k yu, j yun, b zhang, p zhang, t zhang, j zhao, p zhao, j zhou, w zhou, s zhong, x zhong, s zhang, l zhu, p zhu, b zou, j zou, z zuo, f bai, x huang, p zhou*, qinghua jiang*, z huang*, j bei*, l wei*, x bian*, x liu*, t cheng*, x li,*, p zhao*, f wang*, h wang*, b su*, z zhang*, k qu*, x wang*, j chen*, r jin*, z zhang*. covid-19 immune features revealed by a large-scale single cell transcriptome atlas. cell. 2021 apr 1;184(7):1895-1913. (sci if: 38.64)

6) pingping wang#, lifen yao#, meng luo, wenyang zhou, xiyun jin, zhaochun xu, shi yan, yiqun li, chang xu, rui cheng, yan huang, xiaoyu lin, kexin ma, huimin cao, hongxin liu, guangfu xue, fang han, huan nie, qinghua jiang*. single-cell transcriptome and tcr profiling reveal activated and expanded t cell populations in parkinson's disease. cell discovery. 2021 jul 20;7(1):52.  (sci if= 33.5)

7) rui cheng#, lixing xiao#, wenyang zhou#, xiyun jin, zhaochun xu, chang xu, pingping wang, meng luo, mengyun wang, kexin ma, huimin cao, yan huang, xiaoyu lin, fenglan pang, yiqun li, qinghua jiang*. a pan-cancer analysis of alternative splicing of splicing factors in 6904 patients. oncogene. 2021. doi: 10.1038/s41388-021-01947-7 (sci if: 9.87)

8) pingping wang#, zhaochun xu#, wenyang zhou#, xiyun jin, chang xu, meng luo, kexin ma, huimin cao,yan huang, xiaoyu lin, fenglan pang, yiqun li, qinghua jiang*. identification of potential vaccine targets for sars-cov-2 by combining single-cell and bulk tcr sequencing. clinical and translational medicine. 2021 may;11(5):e430. doi: 10.1002/ctm2.430. (sci if: 11.492)

9) fang li#, meng luo#, wenyang zhou#, jinliang li#, xiyun jin, zhaochun xu, liran juan, zheng zhang, yuou li, renqiang liu, yiqun li, chang xu, kexin ma, huimin cao, jingwei wang, pingping wang*, zhigao bu*, qinghua jiang*. single cell rna and immune repertoire profiling of covid-19 patients reveal novel neutralizing antibody. protein cell. 2021, oct;12(10):751-755.. (sci if: 10.16)

10) zhaochun xu#, meng luo#, weizhong lin#, guangfu xue, pingping wang, xiyun jin, chang xu, wenyang zhou, yideng cai, wenyi yang, huan nie, qinghua jiang*. dlptcr: an ensemble deep learning framework for predicting immunogenic peptide recognized by t cell receptor. briefings in bioinformatics. 2021 nov 5;22(6):bbab335. (sci, if= 11.622)

获奖情况

1) 2021 黑龙江省自然科学一等奖（第一完成人：复杂疾病生物信息处理与分析）

2) 2019 黑龙江省自然科学一等奖（第二完成人：基因组大数据分析理论与方法）

3) 2023 爱思唯尔2022年中国高被引学者（生物医学工程领域）

4) 2022 爱思唯尔2021年中国高被引学者（生物医学工程领域）

5) 2021 爱思唯尔2020年中国高被引学者（生物医学工程领域）

6) 2020 获中国百篇最具影响国际学术论文（通讯作者）

7) 2010 获中国百篇最具影响国际学术论文（第一作者）